Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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