Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A4Q9NY91 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms