Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXI6

RNF186, RING finger protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF186Q9NXI6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF186Q9NXI6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms