Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms