Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms