Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms