Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms