Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms