Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TOPORSQ9NS56 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms