Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTL1Q9NRR1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms