Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO8Q9NRD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FBXO8Q9NRD0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms