Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM10Q9NQV6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms