Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms