Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MS4A6AQ9H2W1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MS4A6AQ9H2W1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MS4A6AQ9H2W1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MS4A6AQ9H2W1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A6AQ9H2W1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MS4A6AQ9H2W1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A6AQ9H2W1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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