Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NYXQ9GZU5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms