Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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