Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRCIN1Q9C0H9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms