Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BARHL1Q9BZE3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BARHL1Q9BZE3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms