Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms