Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms