Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms