Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GAL3ST1Q99999 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms