Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms