Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms