Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF48Q96MX3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms