Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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