Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms