Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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UBE2E2Q96LR5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2E2Q96LR5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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UBE2E2Q96LR5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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UBE2E2Q96LR5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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