Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TPD52L3Q96J77 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms