Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRT1Q96EB6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRT1Q96EB6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms