Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms