Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C18orf8Q96DM3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms