Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms