Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCC1Q96CN9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCC1Q96CN9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms