Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms