Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UTP4Q969X6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms