Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms