Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRQ92752 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRQ92752 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRQ92752 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRQ92752 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRQ92752 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRQ92752 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms