Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms