Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms