Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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ZNF397Q8NF99 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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