Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF548Q8NEK5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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