Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNNM3Q8NE01 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms