Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF248Q8NDW4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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