Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00612Q8N6U2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms