Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSGALNACT2Q8N6G5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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