Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms