Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD302Q8IX05 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD302Q8IX05 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD302Q8IX05 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD302Q8IX05 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD302Q8IX05 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD302Q8IX05 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD302Q8IX05 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms