Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms