Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC117Q8IWD4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms